閱讀下列材料回答問題：
材料一：世祖皇帝建元中統(tǒng)以來，始末取故老諸儒之言，考求前代之前典，立朝廷而建官府，輔相者曰：“中書省”；本兵者曰：“樞密院”主彈劾者曰：“御史臺”…夫外之郡縣，其朝廷遠者。則鎮(zhèn)之以行中書省…苦邊徼之事者，則置宣尉可以達之…舉刺之事，則有行御史臺領(lǐng)監(jiān)察御史、肅政廉訪司之。
---引自《元文類》卷四十材料二：據(jù)史書記載，元朝統(tǒng)一全國后的疆域“北逾陰山，西及流沙，東盡遼左，南越海表”即北到西伯利亞，南到南海，西南包括今西藏、云南，西北至今新疆，東北到鄂霍次克海。其疆域之廣，居中國各朝之冠。與漢、唐極盛時期的疆域相比，元朝不僅在面積上大大超過了它們，而且在控制程度上也遠勝于它們。
（1）材料一中掌管全國行政事務(wù)的是哪一機構(gòu)？在歷史上產(chǎn)生深遠影響的是哪一制度？
（2）閱讀材料二元朝為了對遼闊的疆域進行有效的治理，設(shè)立了什么行政機構(gòu)來管轄臺灣？在西藏地區(qū)設(shè)立的宣慰使司都元帥府，由哪一機構(gòu)直接統(tǒng)轄？
（3）通過上述材料，你對于國家領(lǐng)土主權(quán)有什么認識？