新冠病毒是一種單鏈RNA病毒,常用“熒光RT-PCR技術(shù)”(實(shí)時(shí)熒光逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))進(jìn)行檢測(cè),如圖1所示。該過程中當(dāng)TaqMan探針完整時(shí),熒光基團(tuán)(R)發(fā)出的熒光信號(hào)被淬滅基團(tuán)(Q)吸收而不發(fā)熒光;到探針?biāo)忉尫懦鲇坞x的R和Q,R發(fā)出的熒光信號(hào)被相應(yīng)儀器檢測(cè)到,熒光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物數(shù)量完全同步。請(qǐng)分析并回答下列問題。
(1)“熒光RT-PCR技術(shù)”所用的試劑盒中應(yīng)該含有:檢測(cè)者mRNA、熒光標(biāo)記的新冠病毒核酸探針、
耐高溫的DNA聚合酶(TaqDNA聚合酶)
耐高溫的DNA聚合酶(TaqDNA聚合酶)
、逆轉(zhuǎn)錄酶
逆轉(zhuǎn)錄酶
、脫氧核苷酸(dNTP)
脫氧核苷酸(dNTP)
、2種引物、含 Mg2+
Mg2+
(離子)的緩沖體系。
(2)PCR循環(huán)中,加入的引物作用是 使DNA聚合酶能夠從引物的3'端開始連接脫氧核苷酸
使DNA聚合酶能夠從引物的3'端開始連接脫氧核苷酸
。引物、探針與模板結(jié)合發(fā)生在 復(fù)性
復(fù)性
階段。探針核苷酸序列的設(shè)計(jì)依據(jù)是新冠病毒RNA內(nèi)部的一段核糖核苷酸序列(新冠病毒RNA逆轉(zhuǎn)錄形成的DNA的部分核糖核苷酸序列)
新冠病毒RNA內(nèi)部的一段核糖核苷酸序列(新冠病毒RNA逆轉(zhuǎn)錄形成的DNA的部分核糖核苷酸序列)
。
(3)每擴(kuò)增一個(gè)DNA便釋放一個(gè)熒光信號(hào),從而實(shí)現(xiàn)熒光信號(hào)的積累與PCR產(chǎn)物的完全同步。最終可以得到一條熒光擴(kuò)增曲線,如圖2所示。熒光一般要達(dá)到或超過閾值時(shí)才確診為感染了新冠病毒。現(xiàn)有甲、乙兩個(gè)待檢樣本,檢測(cè)時(shí)都出現(xiàn)了圖示形態(tài)的曲線,但甲的a點(diǎn)比乙的a點(diǎn)明顯左移。在試劑盒合格且正常,操作過程規(guī)范且準(zhǔn)確的前提下,該現(xiàn)象出現(xiàn)的原因是甲樣本中的新病毒含量較 高
高
,達(dá)到視值所需的循環(huán)數(shù)更少
少
。
(4)常采用 瓊脂糖凝膠電泳
瓊脂糖凝膠電泳
來鑒定PCR的產(chǎn)物,設(shè)置如下:1號(hào)泳道為標(biāo)準(zhǔn)(Marker),2號(hào)泳道是為陽性對(duì)照組,3號(hào)泳道為實(shí)驗(yàn)組。圖3中3號(hào)泳道出現(xiàn)雜帶,原因一般有 引物設(shè)計(jì)不合理;復(fù)性溫度偏低;DNA聚合酶的質(zhì)量不好等
引物設(shè)計(jì)不合理;復(fù)性溫度偏低;DNA聚合酶的質(zhì)量不好等
(至少寫出2點(diǎn))。